FICA comprendra des composantes distinctes appropriées qui entreprendront diverses tâches allant de la direction générale à l'analyse scientifique. Celles-ci peuvent inclure :

· Le Conseil d'administration
Le Conseil d'administration établira le projet de budget de l'autorité et le travail de surveiller les programmes de mise en œuvre tout en assurant que FICA coopère avec succès avec des organisations partenaires dans toute l'Afrique et au-delà. Il sera également nommer les membres du Comité scientifique et les panneaux et s'accordent sur les réglementations et règles internes.

· Le directeur exécutif
L'ED est le représentant légal de l'Agence qui permettra de gérer les activités quotidiennes du FICA et de nommer tous les membres du personnel de la technique, scientifique, administratif et services de communications. L'ED sera également chargé de l'élaboration des programmes annuels en consultation avec les autorités compétentes.

· Le Forum consultatif
Il sera composé de représentants de chaque pays africain ou les fonctionnaires nationaux traitant avec de la nourriture des questions connexes. Sa principale responsabilité consiste à aider l'ED dans le but d'améliorer la coordination et la communication entre les pays qui ont un programme commun au niveau national.

· Le Comité scientifique
Le SC assistée par un Comité d'experts, donnera scientifique indépendant basé et avis techniques pour aider les FICA à mener des évaluations de risques dans leurs respectifs domaines spécialisés.